Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms