Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPH2Q6IBW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPH2Q6IBW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms