Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CARMIL2Q6F5E8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms