Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC8Q6A555 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC8Q6A555 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms