Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
INTS3Q68E01 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INTS3Q68E01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INTS3Q68E01 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INTS3Q68E01 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
INTS3Q68E01 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
INTS3Q68E01 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
INTS3Q68E01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.51■■■□□ 2
INTS3Q68E01 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms