Protein–RNA interactions for Protein: Q68CL5

TPGS2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS2Q68CL5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPGS2Q68CL5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS2Q68CL5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms