Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L1Q676U5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms