Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM46CQ5VWP2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms