Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AGAP6Q5VW22 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AGAP6Q5VW22 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms