Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN9Q5TKA1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN9Q5TKA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms