Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LDLRAD1Q5T700 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms