Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms