Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHC1Q5JVL4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHC1Q5JVL4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms