Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB41Q5JT25 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms