Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTL5Q5HYW3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL5Q5HYW3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms