Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms