Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COBLL1Q53SF7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms