Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LACTB2Q53H82 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LACTB2Q53H82 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms