Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms