Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCBP3Q53F19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCBP3Q53F19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms