Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0S7

CCDC152, Coiled-coil domain-containing protein 152, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC152Q4G0S7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC152Q4G0S7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC152Q4G0S7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC152Q4G0S7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms