Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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