Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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