Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms