Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWC2Q2TAL6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms