Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms