Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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