Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM187BQ17R55 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms