Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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