Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B3Q16720 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B3Q16720 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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