Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN1Q16658 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN1Q16658 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN1Q16658 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms