Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMN1Q16637 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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