Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NTRK2Q16620 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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