Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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SNAPC1Q16533 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPC1Q16533 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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