Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DDB1Q16531 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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