Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK5Q16478 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK5Q16478 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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