Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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