Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF56Q15929 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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