Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZFHX3Q15911 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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