Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP3Q15836 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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