Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA6Q15825 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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