Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA2Q15822 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA2Q15822 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms