Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP11Q15643 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIP11Q15643 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP11Q15643 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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