Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF1Q15637 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF1Q15637 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF1Q15637 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF1Q15637 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF1Q15637 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SF1Q15637 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF1Q15637 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF1Q15637 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF1Q15637 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms