Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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