Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDSNQ15517 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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