Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3A2Q15428 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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