Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B3Q15393 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B3Q15393 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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