Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB35Q15286 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms