Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD6Q15008 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD6Q15008 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms