Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1DQ13901 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1DQ13901 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1DQ13901 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1DQ13901 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1DQ13901 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1DQ13901 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1DQ13901 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1DQ13901 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1DQ13901 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1DQ13901 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1DQ13901 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C1DQ13901 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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